sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "evolucijske ohranjenosti".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Širši sorodni izrazi
Izrazi, ki navajajo evolucijske ohranjenosti med svojimi sorodnimi izrazi, a jih seznam zgoraj ne doseže. Njihova podobnost je nižja od podobnosti zadnjega izraza nad njimi.
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
V naslednjem koraku smo izvedli še analizo evolucijske ohranjenosti skupkov vezavnih mest.
Sama razpršenost interakcijskih mrež je lahko posledica dejansko manjše evolucijske ohranjenosti genov, ki so vpleteni v omenjena procesa.
S povezavo obeh analiz (evolucijske ohranjenosti in tvorbe interakcij) bomo identificirali ključne aminokisline.
Prvi je ta da običajno kvasovko preučujejo že desetletja in je, zaradi evolucijske ohranjenosti osnovnih procesov pri evkariontih, primeren modelni organizem.
Pri ugotavljanju evolucijske ohranjenosti aminokislinskih ostankov smo kot vzorec vzeli bakterije, ki so si evolucijsko gledano najbolj daleč.
Pri raziskovalnem delu smo se osredotočili predvsem na ugotavljanje esencialnosti encima, evolucijske ohranjenosti njegovih aminokislin in sposobnosti za vezavo zdravilne učinkovine.
Položaje aminokislin smo v histogramu uredili glede na odstotni delež evolucijske ohranjenosti, in sicer ta narašča od leve proti desni.
Poleg visoke evolucijske ohranjenosti navedene aminokisline tvorijo tudi razmeroma visoke deleže tako vodikovih vezi kot drugih interakcij.
GERP vrednost ocenjuje stopnjo evolucijske ohranjenosti posameznih mest.
Analiza z drevesnim prikazom sekvenc omogoča prikaz evolucijske ohranjenosti aminokislinskih zaporedij.
Za ugotavljanje evolucijske ohranjenosti je treba najprej pripraviti poravnavo aminokislinskih zaporedij čim večjega števila homologov .
Stopnje evolucijske ohranjenosti so cela števila od 0 do 9, pri čemer 9 pomeni najvišjo stopnjo ohranjenosti.
Stopnje evolucijske ohranjenosti so označene z vrednostmi od 1 do 9, kjer 1 pomeni visoko variabilnost in 9 visoko stopnjo ohranjenosti.
Temu sta sledila koraka 3 (ocena evolucijske ohranjenosti) in 4 (vrednotenje rezultatov) (44).
Ker esencialnost encima ni zadosten pogoj za razvoj novih učinkovin, bomo izbranim encimom z orodjem ConSurf določili stopnjo evolucijske ohranjenosti aminokislinskih ostankov.
S tem postopkom smo pridobili ustrezna dokumenta, ki smo ju kasneje uporabili pri poizvedbi evolucijske ohranjenosti s spletnim orodjem ConSurf.
Omenjeno vizualizacijo vezavnih mest je bilo smiselno predstaviti tudi glede na obarvanost po barvni lestvici evolucijske ohranjenosti iz strežnika ConSurf.
Percentage identify, PID) vizualno označili stopnjo ohranjenosti aminokislin z modro barvo, ki prikazuje odvisnost odtenka barve od evolucijske ohranjenosti aminokislin (slika 6).
To datoteko smo v programu PyMOL uporabili za nadaljnjo vizualno analizo evolucijske ohranjenosti vezavnih mest za zaviralce in substrate.
E. coli in Shigella, saj je med ribosomskimi proteini teh vrst preveč podobnosti zaradi visoke evolucijske ohranjenosti, kar onemogoča razlikovanje med njimi (11).